El Concilio Misión Cristiana Fuente de Agua Viva se originó el 11 de noviembre de 1983, en Fajardo, Puerto Rico; donde un grupo de pastores se reunieron con el Rev. Rodolfo Font, Apóstol Fundador; para allí formalizar la unión de las iglesias Fuente de Agua Viva.  Sus metas iniciales fueron ampliar el alcance del evangelio, ampliar el alcance y visión de las Iglesias Fuente de Agua Viva, desarrollar hombres y mujeres en el ministerio, crear un centro de enseñanza basado en la Biblia y levantar un instituto bíblico, que hoy se conoce como el Instituto Bíblico Jesucristo es el Señor.

En octubre de 1985 el Concilio Misión Cristiana Fuente de Agua Viva se extiende al ministerio de televisión, al adquirir dos emisoras: Canal 58 en Caguas, PR; y el Canal 32 en Aguadilla, PR.  En contra de las dificultades económicas que se presentaron, el Pastor Font reunió los esfuerzos y el dinero para comprar un canal de televisión y gracias a eso hoy día miles de personas son edificadas por medio de NCN Televisión. En la actualidad nuestra programación sale por sistemas de cable a toda la isla.   ( canales 58 (digital 57) y 50 (digital 62), One linck 15, Liberty 58y Choice 10)

En el 1987 se celebró la primera Convención de las Iglesias Fuente de Agua Viva, en Carolina, Puerto Rico. Entre los diferentes predicadores mundialmente conocidos que han desfilado por la Convención se encuentra: Benny Hinn, Carlton Pearson, John Avanzini, Crefflo Dollar, Myles Munroe, Marcus Bishop, R. W. Shambach, Ayo Oritsejafor, Frederick Price, entre otros.  También se han celebrado convenciones en Long Island, New York y Orlando, Florida.         

Actualmente el Concilio Fuente de Agua Viva  cuente con una junta apostólica compuesta por el Apóstol Robert Gómez, el Apóstol Ricky Rosado y Apóstol Otoniel Font quien actualmente preside el Concilio Fuente de Agua Viva.

Hoy podemos ver el futuro de aquel llamado. Las Iglesias Fuente de Agua Viva se han determinado no a establecer una nueva denominación, y mucho menos creerse ser poseedores de toda la revelación de Dios sino a exaltar la grandeza del único y soberano Señor de Señores y Rey de Reyes, Jesucristo, el Hijo del Dios Viviente.